Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Hoxc5P32043 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxc5P32043 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms