Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASQ1P31415 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASQ1P31415 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASQ1P31415 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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