Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc11P31313 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc11P31313 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc11P31313 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.8 ms