Protein–RNA interactions for Protein: P31025

LCN1, Lipocalin-1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P31025 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN1P31025 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN1P31025 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN1P31025 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN1P31025 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN1P31025 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN1P31025 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN1P31025 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN1P31025 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN1P31025 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P31025 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN1P31025 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN1P31025 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN1P31025 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN1P31025 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN1P31025 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN1P31025 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN1P31025 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCN1P31025 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCN1P31025 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCN1P31025 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCN1P31025 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN1P31025 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN1P31025 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN1P31025 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN1P31025 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN1P31025 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN1P31025 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P31025 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P31025 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P31025 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P31025 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P31025 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P31025 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P31025 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P31025 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P31025 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN1P31025 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN1P31025 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN1P31025 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN1P31025 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN1P31025 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN1P31025 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P31025 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P31025 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P31025 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P31025 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P31025 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P31025 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P31025 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN1P31025 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN1P31025 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN1P31025 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN1P31025 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LCN1P31025 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN1P31025 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN1P31025 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN1P31025 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN1P31025 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN1P31025 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P31025 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P31025 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P31025 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P31025 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P31025 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P31025 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN1P31025 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN1P31025 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN1P31025 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN1P31025 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN1P31025 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN1P31025 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN1P31025 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN1P31025 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN1P31025 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN1P31025 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN1P31025 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN1P31025 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN1P31025 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN1P31025 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN1P31025 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P31025 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P31025 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P31025 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P31025 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P31025 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P31025 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCN1P31025 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms