Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CLIP1P30622 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CLIP1P30622 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CLIP1P30622 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CLIP1P30622 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CLIP1P30622 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms