Protein–RNA interactions for Protein: P30048

PRDX3, Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX3P30048 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDX3P30048 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDX3P30048 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDX3P30048 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDX3P30048 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDX3P30048 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDX3P30048 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDX3P30048 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDX3P30048 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDX3P30048 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms