Protein–RNA interactions for Protein: P30040

ERP29, Endoplasmic reticulum resident protein 29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP29P30040 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERP29P30040 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERP29P30040 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERP29P30040 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERP29P30040 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERP29P30040 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERP29P30040 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERP29P30040 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERP29P30040 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERP29P30040 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERP29P30040 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERP29P30040 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERP29P30040 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERP29P30040 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERP29P30040 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERP29P30040 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERP29P30040 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERP29P30040 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERP29P30040 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERP29P30040 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERP29P30040 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERP29P30040 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERP29P30040 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERP29P30040 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERP29P30040 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERP29P30040 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERP29P30040 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERP29P30040 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERP29P30040 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERP29P30040 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERP29P30040 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERP29P30040 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERP29P30040 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERP29P30040 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERP29P30040 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERP29P30040 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERP29P30040 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERP29P30040 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERP29P30040 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERP29P30040 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERP29P30040 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERP29P30040 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERP29P30040 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERP29P30040 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERP29P30040 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERP29P30040 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERP29P30040 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERP29P30040 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERP29P30040 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERP29P30040 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERP29P30040 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERP29P30040 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERP29P30040 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERP29P30040 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERP29P30040 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERP29P30040 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERP29P30040 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERP29P30040 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERP29P30040 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERP29P30040 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERP29P30040 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERP29P30040 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERP29P30040 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERP29P30040 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERP29P30040 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERP29P30040 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERP29P30040 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERP29P30040 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERP29P30040 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERP29P30040 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERP29P30040 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERP29P30040 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERP29P30040 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERP29P30040 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERP29P30040 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERP29P30040 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERP29P30040 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERP29P30040 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERP29P30040 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERP29P30040 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERP29P30040 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERP29P30040 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERP29P30040 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERP29P30040 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERP29P30040 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERP29P30040 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERP29P30040 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERP29P30040 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERP29P30040 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERP29P30040 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERP29P30040 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERP29P30040 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERP29P30040 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERP29P30040 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERP29P30040 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERP29P30040 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERP29P30040 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERP29P30040 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERP29P30040 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERP29P30040 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms