Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2E2P29084 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E2P29084 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E2P29084 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms