Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kif3aP28741 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Kif3aP28741 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kif3aP28741 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms