Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kif5cP28738 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kif5cP28738 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif5cP28738 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kif5cP28738 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Kif5cP28738 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kif5cP28738 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif5cP28738 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif5cP28738 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif5cP28738 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif5cP28738 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms