Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX2P28328 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX2P28328 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX2P28328 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX2P28328 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX2P28328 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX2P28328 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX2P28328 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX2P28328 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX2P28328 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX2P28328 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX2P28328 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX2P28328 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX2P28328 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX2P28328 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX2P28328 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX2P28328 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX2P28328 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX2P28328 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX2P28328 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX2P28328 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX2P28328 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX2P28328 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX2P28328 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX2P28328 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX2P28328 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX2P28328 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX2P28328 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX2P28328 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX2P28328 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX2P28328 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX2P28328 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX2P28328 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX2P28328 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX2P28328 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX2P28328 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX2P28328 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX2P28328 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX2P28328 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX2P28328 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX2P28328 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX2P28328 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX2P28328 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX2P28328 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX2P28328 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX2P28328 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX2P28328 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX2P28328 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX2P28328 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX2P28328 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX2P28328 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX2P28328 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX2P28328 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX2P28328 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX2P28328 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX2P28328 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX2P28328 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX2P28328 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX2P28328 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX2P28328 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX2P28328 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX2P28328 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX2P28328 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX2P28328 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX2P28328 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX2P28328 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX2P28328 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX2P28328 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX2P28328 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX2P28328 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX2P28328 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX2P28328 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX2P28328 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX2P28328 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX2P28328 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX2P28328 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX2P28328 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX2P28328 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX2P28328 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX2P28328 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX2P28328 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX2P28328 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX2P28328 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX2P28328 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX2P28328 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX2P28328 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms