Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LoxP28301 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LoxP28301 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LoxP28301 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LoxP28301 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LoxP28301 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LoxP28301 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LoxP28301 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LoxP28301 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LoxP28301 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LoxP28301 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LoxP28301 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LoxP28301 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LoxP28301 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LoxP28301 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LoxP28301 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LoxP28301 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LoxP28301 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LoxP28301 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LoxP28301 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LoxP28301 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LoxP28301 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LoxP28301 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LoxP28301 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LoxP28301 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LoxP28301 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LoxP28301 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LoxP28301 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LoxP28301 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LoxP28301 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LoxP28301 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LoxP28301 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LoxP28301 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LoxP28301 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LoxP28301 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LoxP28301 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LoxP28301 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LoxP28301 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LoxP28301 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LoxP28301 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LoxP28301 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LoxP28301 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LoxP28301 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LoxP28301 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LoxP28301 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LoxP28301 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LoxP28301 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LoxP28301 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LoxP28301 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LoxP28301 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LoxP28301 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LoxP28301 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LoxP28301 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LoxP28301 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LoxP28301 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LoxP28301 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LoxP28301 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LoxP28301 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LoxP28301 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LoxP28301 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LoxP28301 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LoxP28301 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LoxP28301 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LoxP28301 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LoxP28301 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LoxP28301 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LoxP28301 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LoxP28301 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LoxP28301 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LoxP28301 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LoxP28301 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LoxP28301 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LoxP28301 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LoxP28301 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LoxP28301 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LoxP28301 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LoxP28301 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LoxP28301 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LoxP28301 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LoxP28301 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LoxP28301 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LoxP28301 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LoxP28301 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LoxP28301 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LoxP28301 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LoxP28301 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LoxP28301 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LoxP28301 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LoxP28301 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LoxP28301 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LoxP28301 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LoxP28301 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LoxP28301 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LoxP28301 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LoxP28301 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LoxP28301 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LoxP28301 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LoxP28301 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LoxP28301 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LoxP28301 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms