Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALRP27797 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALRP27797 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALRP27797 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALRP27797 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALRP27797 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALRP27797 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALRP27797 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALRP27797 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALRP27797 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALRP27797 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALRP27797 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALRP27797 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALRP27797 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALRP27797 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALRP27797 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALRP27797 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALRP27797 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALRP27797 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALRP27797 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALRP27797 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALRP27797 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALRP27797 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALRP27797 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALRP27797 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALRP27797 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALRP27797 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALRP27797 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALRP27797 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALRP27797 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALRP27797 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALRP27797 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALRP27797 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALRP27797 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALRP27797 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALRP27797 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALRP27797 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALRP27797 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALRP27797 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALRP27797 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALRP27797 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALRP27797 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALRP27797 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALRP27797 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALRP27797 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALRP27797 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALRP27797 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALRP27797 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALRP27797 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALRP27797 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALRP27797 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALRP27797 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALRP27797 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALRP27797 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALRP27797 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALRP27797 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALRP27797 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALRP27797 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALRP27797 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALRP27797 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALRP27797 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALRP27797 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALRP27797 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALRP27797 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CALRP27797 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALRP27797 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALRP27797 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALRP27797 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALRP27797 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALRP27797 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALRP27797 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALRP27797 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CALRP27797 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALRP27797 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALRP27797 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALRP27797 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALRP27797 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALRP27797 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALRP27797 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALRP27797 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALRP27797 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALRP27797 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALRP27797 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALRP27797 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALRP27797 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALRP27797 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALRP27797 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALRP27797 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALRP27797 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALRP27797 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALRP27797 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALRP27797 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALRP27797 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALRP27797 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALRP27797 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALRP27797 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALRP27797 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALRP27797 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALRP27797 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALRP27797 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms