Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CADP27708 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CADP27708 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CADP27708 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CADP27708 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CADP27708 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CADP27708 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CADP27708 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CADP27708 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CADP27708 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CADP27708 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CADP27708 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CADP27708 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CADP27708 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADP27708 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADP27708 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CADP27708 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADP27708 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADP27708 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADP27708 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CADP27708 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CADP27708 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CADP27708 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CADP27708 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CADP27708 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CADP27708 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CADP27708 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CADP27708 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CADP27708 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CADP27708 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CADP27708 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CADP27708 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CADP27708 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CADP27708 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CADP27708 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CADP27708 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CADP27708 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CADP27708 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CADP27708 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CADP27708 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CADP27708 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CADP27708 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CADP27708 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CADP27708 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CADP27708 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CADP27708 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CADP27708 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CADP27708 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CADP27708 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CADP27708 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CADP27708 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CADP27708 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CADP27708 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CADP27708 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CADP27708 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CADP27708 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CADP27708 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CADP27708 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CADP27708 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CADP27708 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CADP27708 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CADP27708 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CADP27708 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CADP27708 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CADP27708 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CADP27708 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CADP27708 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CADP27708 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CADP27708 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CADP27708 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CADP27708 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CADP27708 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CADP27708 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CADP27708 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CADP27708 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CADP27708 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CADP27708 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CADP27708 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CADP27708 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CADP27708 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CADP27708 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CADP27708 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CADP27708 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CADP27708 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CADP27708 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CADP27708 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CADP27708 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CADP27708 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CADP27708 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CADP27708 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CADP27708 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CADP27708 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CADP27708 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CADP27708 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CADP27708 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CADP27708 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CADP27708 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CADP27708 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CADP27708 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CADP27708 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms