Protein–RNA interactions for Protein: P27671

Rasgrf1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrf1P27671 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rasgrf1P27671 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rasgrf1P27671 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rasgrf1P27671 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rasgrf1P27671 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rasgrf1P27671 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rasgrf1P27671 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rasgrf1P27671 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rasgrf1P27671 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgrf1P27671 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgrf1P27671 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgrf1P27671 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgrf1P27671 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgrf1P27671 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgrf1P27671 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgrf1P27671 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms