Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtmaP26350 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtmaP26350 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtmaP26350 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtmaP26350 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtmaP26350 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PtmaP26350 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtmaP26350 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtmaP26350 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtmaP26350 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtmaP26350 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtmaP26350 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtmaP26350 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PtmaP26350 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtmaP26350 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtmaP26350 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtmaP26350 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtmaP26350 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtmaP26350 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtmaP26350 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtmaP26350 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtmaP26350 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PtmaP26350 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms