Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnna1P26231 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna1P26231 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna1P26231 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms