Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myf5P24699 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myf5P24699 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myf5P24699 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myf5P24699 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Myf5P24699 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Myf5P24699 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myf5P24699 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Myf5P24699 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myf5P24699 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myf5P24699 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myf5P24699 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myf5P24699 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myf5P24699 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myf5P24699 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myf5P24699 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myf5P24699 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myf5P24699 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myf5P24699 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms