Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria1P23818 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria1P23818 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria1P23818 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria1P23818 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria1P23818 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gria1P23818 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria1P23818 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria1P23818 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria1P23818 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria1P23818 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gria1P23818 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria1P23818 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria1P23818 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria1P23818 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria1P23818 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria1P23818 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria1P23818 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria1P23818 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria1P23818 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gria1P23818 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gria1P23818 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gria1P23818 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gria1P23818 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gria1P23818 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gria1P23818 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gria1P23818 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gria1P23818 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gria1P23818 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gria1P23818 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gria1P23818 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gria1P23818 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gria1P23818 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gria1P23818 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gria1P23818 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gria1P23818 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gria1P23818 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gria1P23818 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms