Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZfaP23607 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZfaP23607 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZfaP23607 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZfaP23607 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZfaP23607 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZfaP23607 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZfaP23607 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms