Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRBP23467 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRBP23467 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRBP23467 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRBP23467 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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