Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPAP23025 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPAP23025 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPAP23025 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPAP23025 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPAP23025 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPAP23025 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XPAP23025 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPAP23025 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
XPAP23025 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPAP23025 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPAP23025 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPAP23025 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XPAP23025 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPAP23025 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPAP23025 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPAP23025 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPAP23025 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPAP23025 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPAP23025 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPAP23025 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPAP23025 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPAP23025 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPAP23025 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPAP23025 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPAP23025 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPAP23025 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPAP23025 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
XPAP23025 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPAP23025 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPAP23025 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPAP23025 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPAP23025 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPAP23025 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPAP23025 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPAP23025 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPAP23025 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPAP23025 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPAP23025 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPAP23025 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPAP23025 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPAP23025 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPAP23025 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPAP23025 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPAP23025 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XPAP23025 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPAP23025 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPAP23025 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPAP23025 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPAP23025 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPAP23025 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPAP23025 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPAP23025 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPAP23025 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPAP23025 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPAP23025 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPAP23025 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPAP23025 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPAP23025 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPAP23025 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPAP23025 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPAP23025 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPAP23025 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPAP23025 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPAP23025 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPAP23025 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPAP23025 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPAP23025 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPAP23025 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPAP23025 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPAP23025 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPAP23025 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPAP23025 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPAP23025 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPAP23025 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
XPAP23025 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPAP23025 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPAP23025 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPAP23025 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPAP23025 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPAP23025 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPAP23025 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPAP23025 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPAP23025 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPAP23025 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPAP23025 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
XPAP23025 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPAP23025 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
XPAP23025 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
XPAP23025 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPAP23025 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
XPAP23025 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPAP23025 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPAP23025 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPAP23025 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPAP23025 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPAP23025 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPAP23025 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPAP23025 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
XPAP23025 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms