Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX1P22670 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX1P22670 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFX1P22670 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFX1P22670 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFX1P22670 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFX1P22670 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFX1P22670 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX1P22670 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX1P22670 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX1P22670 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX1P22670 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFX1P22670 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFX1P22670 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFX1P22670 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFX1P22670 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFX1P22670 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFX1P22670 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RFX1P22670 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFX1P22670 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFX1P22670 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFX1P22670 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFX1P22670 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFX1P22670 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFX1P22670 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFX1P22670 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFX1P22670 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFX1P22670 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFX1P22670 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFX1P22670 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFX1P22670 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RFX1P22670 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFX1P22670 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RFX1P22670 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFX1P22670 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFX1P22670 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX1P22670 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX1P22670 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX1P22670 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX1P22670 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX1P22670 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX1P22670 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFX1P22670 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFX1P22670 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFX1P22670 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFX1P22670 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFX1P22670 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFX1P22670 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX1P22670 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX1P22670 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX1P22670 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFX1P22670 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFX1P22670 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX1P22670 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX1P22670 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX1P22670 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX1P22670 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX1P22670 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX1P22670 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX1P22670 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX1P22670 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX1P22670 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX1P22670 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX1P22670 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX1P22670 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX1P22670 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX1P22670 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX1P22670 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX1P22670 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX1P22670 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX1P22670 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX1P22670 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX1P22670 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX1P22670 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX1P22670 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX1P22670 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX1P22670 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX1P22670 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX1P22670 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX1P22670 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX1P22670 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX1P22670 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX1P22670 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX1P22670 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX1P22670 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX1P22670 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX1P22670 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX1P22670 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX1P22670 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX1P22670 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX1P22670 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX1P22670 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX1P22670 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX1P22670 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX1P22670 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX1P22670 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX1P22670 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX1P22670 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX1P22670 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX1P22670 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms