Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCMT1P22061 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms