Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TAF1P21675 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TAF1P21675 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TAF1P21675 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TAF1P21675 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TAF1P21675 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TAF1P21675 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TAF1P21675 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TAF1P21675 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TAF1P21675 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TAF1P21675 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TAF1P21675 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TAF1P21675 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TAF1P21675 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TAF1P21675 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TAF1P21675 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
TAF1P21675 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TAF1P21675 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TAF1P21675 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TAF1P21675 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TAF1P21675 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TAF1P21675 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TAF1P21675 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TAF1P21675 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TAF1P21675 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TAF1P21675 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TAF1P21675 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TAF1P21675 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TAF1P21675 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TAF1P21675 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TAF1P21675 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TAF1P21675 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TAF1P21675 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TAF1P21675 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TAF1P21675 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TAF1P21675 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TAF1P21675 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TAF1P21675 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TAF1P21675 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TAF1P21675 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TAF1P21675 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TAF1P21675 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TAF1P21675 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TAF1P21675 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TAF1P21675 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TAF1P21675 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TAF1P21675 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TAF1P21675 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TAF1P21675 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TAF1P21675 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TAF1P21675 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TAF1P21675 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TAF1P21675 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TAF1P21675 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TAF1P21675 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TAF1P21675 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TAF1P21675 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TAF1P21675 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TAF1P21675 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TAF1P21675 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TAF1P21675 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TAF1P21675 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TAF1P21675 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TAF1P21675 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TAF1P21675 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TAF1P21675 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
TAF1P21675 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TAF1P21675 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TAF1P21675 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TAF1P21675 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TAF1P21675 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TAF1P21675 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TAF1P21675 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TAF1P21675 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TAF1P21675 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TAF1P21675 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
TAF1P21675 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TAF1P21675 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TAF1P21675 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TAF1P21675 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TAF1P21675 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TAF1P21675 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TAF1P21675 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TAF1P21675 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TAF1P21675 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TAF1P21675 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
TAF1P21675 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TAF1P21675 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TAF1P21675 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TAF1P21675 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TAF1P21675 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TAF1P21675 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TAF1P21675 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TAF1P21675 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TAF1P21675 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TAF1P21675 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TAF1P21675 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TAF1P21675 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TAF1P21675 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TAF1P21675 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms