Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Myo5bP21271 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Myo5bP21271 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Myo5bP21271 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo5bP21271 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myo5bP21271 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms