Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Tpm3P21107 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpm3P21107 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm3P21107 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm3P21107 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms