Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCP20941 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCP20941 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCP20941 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCP20941 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCP20941 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCP20941 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCP20941 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCP20941 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCP20941 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCP20941 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCP20941 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCP20941 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCP20941 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCP20941 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCP20941 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCP20941 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCP20941 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCP20941 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCP20941 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCP20941 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCP20941 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDCP20941 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDCP20941 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDCP20941 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDCP20941 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDCP20941 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDCP20941 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCP20941 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCP20941 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCP20941 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCP20941 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCP20941 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCP20941 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCP20941 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCP20941 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCP20941 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCP20941 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCP20941 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCP20941 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCP20941 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCP20941 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCP20941 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCP20941 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCP20941 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCP20941 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCP20941 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCP20941 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCP20941 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCP20941 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCP20941 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCP20941 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCP20941 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCP20941 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCP20941 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCP20941 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCP20941 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCP20941 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCP20941 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCP20941 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCP20941 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCP20941 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCP20941 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCP20941 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCP20941 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCP20941 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCP20941 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCP20941 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCP20941 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCP20941 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCP20941 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCP20941 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCP20941 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCP20941 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCP20941 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCP20941 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCP20941 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCP20941 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCP20941 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCP20941 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCP20941 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCP20941 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCP20941 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCP20941 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCP20941 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms