Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB1P20618 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB1P20618 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms