Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCN2P20062 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCN2P20062 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCN2P20062 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCN2P20062 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCN2P20062 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCN2P20062 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCN2P20062 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCN2P20062 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN2P20062 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN2P20062 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN2P20062 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN2P20062 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN2P20062 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN2P20062 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCN2P20062 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN2P20062 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN2P20062 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN2P20062 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN2P20062 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN2P20062 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN2P20062 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN2P20062 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN2P20062 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN2P20062 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN2P20062 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN2P20062 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCN2P20062 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCN2P20062 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCN2P20062 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCN2P20062 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCN2P20062 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCN2P20062 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCN2P20062 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN2P20062 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN2P20062 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN2P20062 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN2P20062 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN2P20062 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCN2P20062 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCN2P20062 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCN2P20062 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCN2P20062 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCN2P20062 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN2P20062 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN2P20062 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN2P20062 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN2P20062 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN2P20062 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN2P20062 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN2P20062 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCN2P20062 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCN2P20062 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN2P20062 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN2P20062 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN2P20062 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN2P20062 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN2P20062 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN2P20062 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN2P20062 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN2P20062 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN2P20062 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN2P20062 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN2P20062 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN2P20062 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN2P20062 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN2P20062 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN2P20062 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN2P20062 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCN2P20062 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCN2P20062 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCN2P20062 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCN2P20062 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN2P20062 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN2P20062 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN2P20062 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN2P20062 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN2P20062 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN2P20062 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN2P20062 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN2P20062 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN2P20062 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN2P20062 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN2P20062 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN2P20062 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN2P20062 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN2P20062 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN2P20062 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN2P20062 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN2P20062 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN2P20062 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN2P20062 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN2P20062 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN2P20062 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN2P20062 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN2P20062 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCN2P20062 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCN2P20062 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCN2P20062 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCN2P20062 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms