Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM21P19474 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM21P19474 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM21P19474 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM21P19474 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.3 ms