Protein–RNA interactions for Protein: P19473

Trap1a, Tumor rejection antigen P815A, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1aP19473 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trap1aP19473 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trap1aP19473 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trap1aP19473 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trap1aP19473 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms