Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC3P19447 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERCC3P19447 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERCC3P19447 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms