Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefhP19246 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefhP19246 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefhP19246 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefhP19246 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NefhP19246 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NefhP19246 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NefhP19246 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefhP19246 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NefhP19246 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NefhP19246 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NefhP19246 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NefhP19246 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NefhP19246 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NefhP19246 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NefhP19246 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NefhP19246 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NefhP19246 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefhP19246 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NefhP19246 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefhP19246 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefhP19246 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefhP19246 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NefhP19246 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefhP19246 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefhP19246 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefhP19246 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NefhP19246 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefhP19246 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NefhP19246 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NefhP19246 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NefhP19246 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NefhP19246 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NefhP19246 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NefhP19246 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NefhP19246 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NefhP19246 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NefhP19246 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NefhP19246 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NefhP19246 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NefhP19246 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NefhP19246 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NefhP19246 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NefhP19246 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NefhP19246 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NefhP19246 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NefhP19246 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NefhP19246 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NefhP19246 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NefhP19246 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NefhP19246 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NefhP19246 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NefhP19246 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NefhP19246 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NefhP19246 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NefhP19246 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NefhP19246 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NefhP19246 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefhP19246 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NefhP19246 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefhP19246 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefhP19246 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefhP19246 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefhP19246 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefhP19246 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NefhP19246 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefhP19246 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NefhP19246 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefhP19246 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefhP19246 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefhP19246 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefhP19246 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefhP19246 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NefhP19246 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefhP19246 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefhP19246 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefhP19246 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefhP19246 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NefhP19246 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NefhP19246 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NefhP19246 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NefhP19246 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NefhP19246 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NefhP19246 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NefhP19246 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefhP19246 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefhP19246 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefhP19246 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefhP19246 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefhP19246 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefhP19246 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefhP19246 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefhP19246 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefhP19246 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefhP19246 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefhP19246 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefhP19246 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefhP19246 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefhP19246 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefhP19246 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms