Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI1P19237 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TNNI1P19237 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNI1P19237 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI1P19237 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms