Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN8P19075 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPAN8P19075 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN8P19075 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN8P19075 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN8P19075 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms