Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH2P19022 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH2P19022 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH2P19022 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH2P19022 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH2P19022 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH2P19022 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH2P19022 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH2P19022 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH2P19022 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH2P19022 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH2P19022 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH2P19022 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH2P19022 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH2P19022 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH2P19022 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH2P19022 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH2P19022 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH2P19022 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH2P19022 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH2P19022 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH2P19022 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH2P19022 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH2P19022 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH2P19022 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH2P19022 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH2P19022 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH2P19022 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH2P19022 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH2P19022 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH2P19022 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH2P19022 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH2P19022 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH2P19022 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH2P19022 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH2P19022 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH2P19022 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH2P19022 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH2P19022 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH2P19022 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH2P19022 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH2P19022 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH2P19022 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH2P19022 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH2P19022 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH2P19022 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH2P19022 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH2P19022 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH2P19022 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH2P19022 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH2P19022 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH2P19022 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH2P19022 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH2P19022 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH2P19022 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH2P19022 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH2P19022 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH2P19022 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH2P19022 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH2P19022 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH2P19022 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH2P19022 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH2P19022 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH2P19022 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH2P19022 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH2P19022 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH2P19022 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH2P19022 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH2P19022 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH2P19022 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH2P19022 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH2P19022 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH2P19022 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH2P19022 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH2P19022 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH2P19022 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH2P19022 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH2P19022 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH2P19022 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH2P19022 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH2P19022 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH2P19022 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH2P19022 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH2P19022 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH2P19022 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH2P19022 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH2P19022 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH2P19022 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH2P19022 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH2P19022 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH2P19022 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH2P19022 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH2P19022 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH2P19022 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH2P19022 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH2P19022 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH2P19022 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH2P19022 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH2P19022 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH2P19022 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms