Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATF1P18846 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATF1P18846 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATF1P18846 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF1P18846 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF1P18846 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF1P18846 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF1P18846 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF1P18846 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF1P18846 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF1P18846 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF1P18846 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF1P18846 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF1P18846 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF1P18846 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF1P18846 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF1P18846 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF1P18846 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF1P18846 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF1P18846 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF1P18846 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF1P18846 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF1P18846 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF1P18846 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF1P18846 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF1P18846 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF1P18846 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF1P18846 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF1P18846 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF1P18846 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF1P18846 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF1P18846 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF1P18846 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF1P18846 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF1P18846 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF1P18846 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF1P18846 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF1P18846 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF1P18846 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF1P18846 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF1P18846 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF1P18846 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF1P18846 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF1P18846 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF1P18846 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF1P18846 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF1P18846 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF1P18846 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF1P18846 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF1P18846 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF1P18846 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF1P18846 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF1P18846 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF1P18846 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF1P18846 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF1P18846 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF1P18846 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF1P18846 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF1P18846 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF1P18846 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF1P18846 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF1P18846 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF1P18846 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF1P18846 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF1P18846 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF1P18846 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF1P18846 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF1P18846 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF1P18846 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF1P18846 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF1P18846 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF1P18846 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF1P18846 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF1P18846 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF1P18846 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF1P18846 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF1P18846 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF1P18846 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF1P18846 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF1P18846 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF1P18846 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF1P18846 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF1P18846 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF1P18846 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF1P18846 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF1P18846 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF1P18846 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF1P18846 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF1P18846 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF1P18846 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF1P18846 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF1P18846 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF1P18846 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF1P18846 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF1P18846 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF1P18846 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF1P18846 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF1P18846 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF1P18846 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF1P18846 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms