Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFEP18615 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFEP18615 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFEP18615 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFEP18615 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFEP18615 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFEP18615 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFEP18615 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFEP18615 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFEP18615 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFEP18615 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFEP18615 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFEP18615 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFEP18615 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELFEP18615 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELFEP18615 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELFEP18615 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELFEP18615 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELFEP18615 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFEP18615 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFEP18615 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFEP18615 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFEP18615 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFEP18615 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFEP18615 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFEP18615 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFEP18615 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFEP18615 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFEP18615 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFEP18615 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFEP18615 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFEP18615 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFEP18615 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFEP18615 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFEP18615 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFEP18615 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFEP18615 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFEP18615 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFEP18615 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFEP18615 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFEP18615 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFEP18615 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFEP18615 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFEP18615 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NELFEP18615 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NELFEP18615 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NELFEP18615 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NELFEP18615 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELFEP18615 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELFEP18615 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELFEP18615 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFEP18615 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFEP18615 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFEP18615 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFEP18615 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFEP18615 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFEP18615 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFEP18615 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFEP18615 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFEP18615 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFEP18615 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFEP18615 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFEP18615 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELFEP18615 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFEP18615 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFEP18615 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFEP18615 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFEP18615 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELFEP18615 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFEP18615 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFEP18615 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFEP18615 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFEP18615 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELFEP18615 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFEP18615 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFEP18615 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFEP18615 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFEP18615 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFEP18615 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFEP18615 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELFEP18615 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NELFEP18615 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NELFEP18615 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFEP18615 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFEP18615 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFEP18615 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NELFEP18615 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFEP18615 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFEP18615 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFEP18615 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFEP18615 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFEP18615 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELFEP18615 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFEP18615 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFEP18615 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFEP18615 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFEP18615 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFEP18615 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFEP18615 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELFEP18615 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms