Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCP1P17987 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCP1P17987 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCP1P17987 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCP1P17987 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCP1P17987 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCP1P17987 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCP1P17987 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCP1P17987 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TCP1P17987 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCP1P17987 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TCP1P17987 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TCP1P17987 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCP1P17987 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TCP1P17987 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCP1P17987 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCP1P17987 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCP1P17987 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCP1P17987 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCP1P17987 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP1P17987 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP1P17987 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP1P17987 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP1P17987 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP1P17987 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP1P17987 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP1P17987 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP1P17987 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP1P17987 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP1P17987 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCP1P17987 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCP1P17987 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP1P17987 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP1P17987 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP1P17987 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP1P17987 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP1P17987 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP1P17987 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP1P17987 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP1P17987 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP1P17987 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP1P17987 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP1P17987 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP1P17987 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP1P17987 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP1P17987 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP1P17987 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP1P17987 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP1P17987 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP1P17987 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP1P17987 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP1P17987 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP1P17987 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP1P17987 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP1P17987 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP1P17987 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP1P17987 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP1P17987 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP1P17987 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCP1P17987 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCP1P17987 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCP1P17987 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCP1P17987 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCP1P17987 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCP1P17987 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCP1P17987 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP1P17987 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP1P17987 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP1P17987 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP1P17987 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCP1P17987 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCP1P17987 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCP1P17987 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCP1P17987 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCP1P17987 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCP1P17987 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCP1P17987 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCP1P17987 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP1P17987 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP1P17987 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP1P17987 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP1P17987 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP1P17987 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP1P17987 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP1P17987 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP1P17987 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP1P17987 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP1P17987 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP1P17987 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP1P17987 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP1P17987 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP1P17987 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP1P17987 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP1P17987 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP1P17987 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP1P17987 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP1P17987 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP1P17987 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP1P17987 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP1P17987 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms