Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxb1P17919 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxb1P17919 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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