Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata1P17679 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata1P17679 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata1P17679 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata1P17679 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata1P17679 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata1P17679 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata1P17679 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata1P17679 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata1P17679 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata1P17679 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms