Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB6P17509 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB6P17509 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms