Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmga1P17095 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmga1P17095 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmga1P17095 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmga1P17095 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms