Protein–RNA interactions for Protein: P15806

Tcf3, Transcription factor E2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf3P15806 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcf3P15806 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcf3P15806 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf3P15806 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms