Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30aP15533 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim30aP15533 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim30aP15533 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30aP15533 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms