Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme1P15532 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nme1P15532 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme1P15532 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme1P15532 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme1P15532 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme1P15532 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme1P15532 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme1P15532 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme1P15532 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme1P15532 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms