Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF2P15336 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF2P15336 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF2P15336 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF2P15336 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF2P15336 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF2P15336 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF2P15336 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF2P15336 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF2P15336 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF2P15336 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF2P15336 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF2P15336 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF2P15336 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF2P15336 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF2P15336 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF2P15336 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF2P15336 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF2P15336 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF2P15336 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF2P15336 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF2P15336 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF2P15336 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF2P15336 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF2P15336 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF2P15336 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF2P15336 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF2P15336 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF2P15336 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF2P15336 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF2P15336 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF2P15336 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF2P15336 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF2P15336 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF2P15336 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF2P15336 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF2P15336 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF2P15336 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF2P15336 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF2P15336 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF2P15336 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF2P15336 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF2P15336 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF2P15336 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF2P15336 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF2P15336 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF2P15336 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF2P15336 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF2P15336 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF2P15336 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF2P15336 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF2P15336 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF2P15336 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF2P15336 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF2P15336 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF2P15336 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF2P15336 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF2P15336 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF2P15336 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF2P15336 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF2P15336 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF2P15336 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF2P15336 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF2P15336 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF2P15336 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF2P15336 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF2P15336 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF2P15336 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF2P15336 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF2P15336 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF2P15336 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF2P15336 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF2P15336 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF2P15336 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF2P15336 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF2P15336 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF2P15336 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF2P15336 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF2P15336 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF2P15336 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF2P15336 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF2P15336 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF2P15336 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF2P15336 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF2P15336 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF2P15336 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF2P15336 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF2P15336 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF2P15336 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF2P15336 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF2P15336 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF2P15336 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF2P15336 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF2P15336 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF2P15336 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF2P15336 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF2P15336 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF2P15336 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF2P15336 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF2P15336 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms