Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD8P13378 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD8P13378 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXD8P13378 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXD8P13378 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXD8P13378 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXD8P13378 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXD8P13378 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD8P13378 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD8P13378 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD8P13378 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD8P13378 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD8P13378 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXD8P13378 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXD8P13378 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXD8P13378 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXD8P13378 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD8P13378 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD8P13378 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD8P13378 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HOXD8P13378 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD8P13378 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms