Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vpreb1P13372 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms